Né à Cadix, en Espagne, Andrew Fernando Holmes obtient son doctorat en médecine à l’Université d’Édimbourg en 1819. Il enseigne ensuite la botanique et la chimie à la Montreal Medical Institution, qui, en 1929, devient la Faculté de médecine de 91Ë¿¹ÏÊÓƵ. A. F. Holmes devient le premier professeur de botanique de l’établissement en 1829, et le premier doyen de la Faculté de médecine en 1854.
Membre actif de la Société d’histoire naturelle de Montréal, il a recueilli dans les années 1820 de nombreux échantillons sur le mont Royal et dans les environs de Montréal. Son herbier de 600 feuilles a été offert à l’Université 91Ë¿¹ÏÊÓƵ en 1856 et est devenu le noyau de l’herbier actuel.